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寶誠生物助力安徽省阜陽市疾控中心順利完成國內第一臺MK1C測序儀裝機測序
發表日期:2020-04-29

2020年4月19日至21日,寶誠生物完成了國內Nanopore新款測序儀MK1C在安徽省阜陽市疾病預防控制中心的裝機任務。在3月27-28日,我公司就積極響應阜陽疾控中心關于盡快落實測序系統投入疫情防控的要求,提前投入了一臺MinION測序儀,并進行了詳細的實驗和生信分析培訓。由于前期已經過詳細的培訓,所以本次MK1C的裝機過程非常順利。 

在此特別感謝阜陽市疾控中心相領導、檢驗科卜科長、郭老師、張老師等對我們工作的支持。看到他們為了疫情防控追趕工作進度,檢驗科的老師吃住在單位,做到樣本隨到隨做,這種忘我的實干精神深深感染了我們,我司技術支持也臨時調整優化了安裝培訓方案,進行穿插式培訓,每天與客戶一起工作到凌晨1點多,得到了用戶的充分肯定與好評。


 

在本次裝機培訓中心,阜陽疾控中心應用柏熠科技K0212新冠全基因組捕獲試劑盒進行新冠病毒的全基因組捕獲,SQK-LSK109 1D試劑盒連接法文庫構建,成功完成了對新冠病毒樣本的全基因組測序并上傳BIGD國家基因組科學數據庫,基因組覆蓋度超過99.5%,為戰疫推進做出自己的貢獻。

 

實驗結束之后老師表示Oxford Nanopore的MK1C測序儀的便攜與實時性,該設備的投入使用,能大大加強他們對于本次新冠疫情的變異分析及溯源工作,同時對于常規檢測無法確定的未知微生物致病源,可以很好地解決這個問題,提供很多檢測方向的思路,鑒于目前的檢測結果非常令人滿意,他們表示馬上開始下一批次樣本的實驗檢測。

Nanopore測序具有實時性、長讀長的特點,目前實際操作中讀取的最長DNA片段長度大于2Mb。此外,nanopore可以直接測序DNA和RNA,不需要PCR擴增,使得測序無擴增偏差。而nanopore的文庫制備簡單,測序儀便攜,可以攜帶至現場進行測序等特點,真正意義上做到了使任何人在任何地點都可以進行測序這樣的理念。

Oxford Nanopore是一家技術型公司,公司針對通量大小推出以下測序產品,分別是:Flongle,MinION, MinION MK1C,GridION和 PromethION. 公司注重技術的開發,現有員工300余人,涉及多重學科和領域。針對不同的應用領域,Nanopore有不同的指導方案。現階段,Nanopore測序儀在微生物耐病毒耐藥性及致病性,環境研究,植物研究,癌癥研究,臨床研究,微生物組,轉錄組分析等領域都有大量的應用。

 

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